Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Brms1Q99N20 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Brms1Q99N20 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms