Protein–RNA interactions for Protein: Q99M54

Cdca3, Cell division cycle-associated protein 3, mousemouse

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Length 266 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca3Q99M54 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdca3Q99M54 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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