Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR7

Ppif, Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase F, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpifQ99KR7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PpifQ99KR7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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