Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lactb2Q99KR3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.8 ms