Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rab28Q99KL7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms