Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Nlgn1Q99K10 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nlgn1Q99K10 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms