Protein–RNA interactions for Protein: Q99JZ0

Sdcbp2, Syntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdcbp2Q99JZ0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdcbp2Q99JZ0 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms