Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

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Length 322 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Sfxn1Q99JR1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sfxn1Q99JR1 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sfxn1Q99JR1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Sfxn1Q99JR1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sfxn1Q99JR1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms