Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cdk9Q99J95 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Cdk9Q99J95 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cdk9Q99J95 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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Cdk9Q99J95 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cdk9Q99J95 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cdk9Q99J95 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Cdk9Q99J95 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cdk9Q99J95 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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