Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Slc8b1Q925Q3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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Slc8b1Q925Q3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Slc8b1Q925Q3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc8b1Q925Q3 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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