Protein–RNA interactions for Protein: Q924C5

Alpk3, Alpha-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alpk3Q924C5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Alpk3Q924C5 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Alpk3Q924C5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms