Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Apol9aQ8VDU3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Apol9aQ8VDU3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms