Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Stx18Q8VDS8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Stx18Q8VDS8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Stx18Q8VDS8 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms