Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCZ8

Rpusd1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd1Q8VCZ8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Rpusd1Q8VCZ8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Rpusd1Q8VCZ8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms