Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trim29Q8R2Q0 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms