Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2G6

Ccdc80, Coiled-coil domain-containing protein 80, mousemouse

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc80Q8R2G6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc80Q8R2G6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms