Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1P4

Atg10, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG10, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg10Q8R1P4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Atg10Q8R1P4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Atg10Q8R1P4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms