Protein–RNA interactions for Protein: Q8R105

Vps37c, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37cQ8R105 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Vps37cQ8R105 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Vps37cQ8R105 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms