Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trpv3Q8K424 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trpv3Q8K424 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms