Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
OptnQ8K3K8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
OptnQ8K3K8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms