Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Abcf3Q8K268 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Abcf3Q8K268 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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