Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Upp2Q8CGR7 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Upp2Q8CGR7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Upp2Q8CGR7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Upp2Q8CGR7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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