Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG5

Ccdc28b, Coiled-coil domain-containing protein 28B, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28bQ8CEG5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28bQ8CEG5 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28bQ8CEG5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms