Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cacnb2Q8CC27 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cacnb2Q8CC27 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms