Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Samd4aQ8CBY1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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