Protein–RNA interactions for Protein: Q8BYK6

Ythdf3, YTH domain-containing family protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdf3Q8BYK6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ythdf3Q8BYK6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ythdf3Q8BYK6 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ythdf3Q8BYK6 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms