Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cnpy4Q8BQ47 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Cnpy4Q8BQ47 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cnpy4Q8BQ47 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms