Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smarcal1Q8BJL0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Smarcal1Q8BJL0 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms