Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Cdca8Q8BHX3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Cdca8Q8BHX3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms