Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW9

H2-M10.2, Histocompatibility 2, M region locus 10.2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.2Q85ZW9 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
H2-M10.2Q85ZW9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M10.2Q85ZW9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms