Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccdc50Q810U5 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms