Protein–RNA interactions for Protein: Q80YS5

Lrrc27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc27Q80YS5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrc27Q80YS5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms