Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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