Protein–RNA interactions for Protein: Q80UQ2

Rassf6, Ras association domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf6Q80UQ2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rassf6Q80UQ2 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms