Protein–RNA interactions for Protein: Q80U87

Usp8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,080 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp8Q80U87 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Usp8Q80U87 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Usp8Q80U87 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp8Q80U87 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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