Protein–RNA interactions for Protein: Q80U04

Pja2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, mousemouse

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pja2Q80U04 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pja2Q80U04 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms