Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Clec18aQ7TSQ1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Clec18aQ7TSQ1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Clec18aQ7TSQ1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Clec18aQ7TSQ1 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Clec18aQ7TSQ1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Clec18aQ7TSQ1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Clec18aQ7TSQ1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Clec18aQ7TSQ1 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Clec18aQ7TSQ1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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