Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ckap2lQ7TS74 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms