Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Clec4b1Q7TS58 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clec4b1Q7TS58 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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