Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms