Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWZ2

Ube2r2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2r2Q6ZWZ2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ube2r2Q6ZWZ2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms