Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ssxb3Q6XAS4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Ssxb3Q6XAS4 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ssxb3Q6XAS4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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