Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ssx9Q6XAS3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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