Protein–RNA interactions for Protein: Q6VUP9

Tfap2e, Transcription factor AP-2-epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2eQ6VUP9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Tfap2eQ6VUP9 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms