Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptx4Q6RUU0 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptx4Q6RUU0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms