Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB75

Papd7, Non-canonical poly(A) RNA polymerase PAPD7, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Papd7Q6PB75 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Papd7Q6PB75 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Papd7Q6PB75 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms