Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
BC061212Q6P8K3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms