Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gpbp1l1Q6NZP2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms