Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rprd2Q6NXI6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rprd2Q6NXI6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms