Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS69

Amer3, APC membrane recruitment protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amer3Q6NS69 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Amer3Q6NS69 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms